Dengan mengacu pada VISI MTsS Syamsuddhuha Yaitu Terwujudnya Madrasah yang Unggul dalam Bidang IMTAQ dan IPTEK yang berlandaskan Akhlakul Karimah serta Tercapainya kualitas Madrasah Berstandar Nasional, Maka Tujuan MTsS Syamsuddhuha dapat dijabarkan sebagai berikut;
- Meningkatkan Iman dan Taqwa serta berakhlakul karimah seluruh warga madrasah;
- Menyusun dan mengembangkan RPP kelas 7, 8, dan 9 untuk semua mata pelajaran;
- Mengembangkan profesionalisme dan kopetensi tenaga pendidik dan kependidikan;
- Mengembangkan strategi pembelajaran;
- Mengembangkan bahan dan sumber pelajaran;
- Mengembangkan strategi penilaian;
- Mengembangkan pola pembelajaran;
- Mengembangkan media pembelajaran;
- Menerapkan implementasi model evaluasi pembelajaran;
- Mengembangkan instrumen atau perangkat-perangkat soal-soal untuk berbagai model evaluasi;
- Menerapkan model-model pembelajaran bagi siswa berprestasi, bermasalah, dan kelompok siswa lainnya;
- Mengembangkan sarana dan prasarana pendidikan;
- Menciptakan lingkungan belajar yang kondusif;
- Mengembangkan standar pencapaian ketuntasan belajar;
- Meningkatkan KKM secara optimal;
- Meningkatkan prestasi siswa dalam bidang akademik dan non akdemik;
- Mengembangkan perangkat administrasi madrasah;
- Melaksanakan supervisi dan monitoring oleh kepala madrasah;
- Mengembangkan madrasah menuju tercapainya Standar Pelayanan Minimal (SPM);
- Menggalang partisipasi masyarakat;
- Mengembangkan jaringan informasi akdemik di internal madrasah;
- Memberdayakan potensi madrasah dan lingkungan;
- Melaksanakan jaringan kerja secara vertikal dan horizontal;
- Mengembangkan jalinan kerja dengan penyandang dana;
- Menciptakan usaha-usaha di lingkungan madrasah dan sekitarnya
